Gagal ginjal kronis dapat memengaruhi hampir seluruh anggota tubuh. Komplikasi yang dapat ditimbulkan antara lain:
- Penumpukan cairan pada bagian tubuh (edema) atau organ dalam, termasuk di paru-paru (edema paru)
- Hiperkalemia, yaitu tingginya kadar kalium dalam darah yang dapat mengganggu fungsi jantung, bahkan bisa menyebabkan henti jantung
- Asidosis
- Anemia berkepanjangan
- Kerusakan sistem saraf pusat, yang dapat menimbulkan gangguan mulai dari sulit berkonsentrasi hingga perubahan kepribadian atau kejang
- Penurunan daya tahan tubuh sehingga penderita rentan terserang infeksi
- Perikarditis atau peradangan pada perikardium (lapisan yang menyelimuti jantung)
- Tulang menjadi lemah dan rentan patah
- Disfungsi ereksi atau penurunan kesuburan pada pria